北理工作为中国共产党创办的第一所理工科大学，建校85年来，始终坚持“为党育人、为国育才”的初心使命。面对新一轮科技革命和产业变革，为响应国家对拔尖创新工程技术人才的迫切需求，2022年9月，教育部首批批准学校建设国家卓越工程师学院。学校党委高度重视，第一时间批准成立卓越工程师学院二级机构，并给予多方面资源支持，旨在将其打造为服务国家重大战略、培养国家杰出工程技术人才的重要平台，标志着学校在深化工程硕博士培养改革方面迈出了关键一步。
学院致力于培养“政治素质过硬、工程技术基础扎实、解决复杂工程问题能力突出、致力于服务国家重大战略”的卓越工程师。
核心任务： 持续深化“6+1”育人模式，完善导师激励机制与全过程协同指导体系，解决校企合作中的痛点与难点，提升工程硕博士培养质量。
未来愿景： 通过建设校企深度协同的示范区和国家战略急需人才的供给区，学院将进一步提升工程专业学位人才培养能力，不仅要让学生“留得下、用得上”，更要成为支撑高水平科技自立自强的国家级卓越人才培养高地。
卓越工程师学院院徽以深蓝色为主色调，上方图案采用了北京理工大学校徽中的和平鸽造型，寓意和平；中间部分由两个轴对称的大写字母“E”构成，分别代表Excellent（卓越）和Education （教育），中间“工”字代表“工程”、下方“T”代表Technology（技术），这几个字母和汉字组成“早”字，代表卓越工程师要早培养、早入企；“早”字与顶部北理工校徽中的和平鸽相结合，近似为“卓”字，从而完整诠释“卓越工程师”的核心内涵；整体图案形似一本翻开的书与盾牌，书象征知识宝库，盾牌寓意用知识保卫国家安全，体现了学院对学生博学笃行的期待，亦代表科技报国的使命担当。