卓越工程师学院党委以“党建引领卓越，红色铸魂工程”为主线，将政治引领与工程人才培养深度融合，构建了“理论铸魂、实践砺行、先锋引领”三位一体的党建工作格局。学院党委定期组织“工程师精神”专题学习会，邀请航天科技集团、中国工程物理研究院等单位的党员专家分享“大国重器”背后的报国故事，将“两弹一星”精神、载人航天精神融入理想信念教育；开展“红色工程师”实践行活动，组织师生党员赴重大工程现场、爱国主义教育基地开展实地研学，在港珠澳大桥、白鹤滩水电站等“国家名片”工程中感悟科技报国使命。
在育人实践中，学院创新实施“双带头人”培育工程，推动党建与业务工作同频共振：教研室党支部与企业研发党支部结对共建，联合开展“技术攻关党旗红”主题党日活动，把党建会议开到项目现场、实验室和企业车间；设立“党员先锋岗”，在毕业设计、企业实习、科研攻关等关键环节发挥党员师生带头作用；组建“青年工程师党员服务队”，鼓励学生党员参与乡村振兴科技帮扶、企业技术难题诊断等社会服务。这些活动不仅强化了师生的政治素养，更将党建优势转化为破解“卡脖子”技术难题的攻坚动力，实现了“党建强、业务精、人才兴”的良性循环。